澳門回歸祖國以來，中央高度重視澳門發展。2004年起實施“內地與澳門更緊密經貿關係安排”（CEPA），並先後簽署10個補充協議，澳門産品基本都能免關稅進入國內。內地已成為澳門最大貿易夥伴和進口來源地，也是澳門的第三大出口市場。2013年，內地與澳門貿易額為35.1億美元。
為支持澳門經濟社會發展，國家商務部與特區政府設立“內地與澳門特區商貿聯委會”，形成定期溝通協調機制。國家旅遊局、環保總局、質檢總局、科技部等與特區政府建立了對口交流渠道。國家有關部委與特區政府在教育、科學、文化、衞生和體育等方面簽訂了相關合作協議。司法、治安、海關等領域也建立了兩地交流合作機制。
澳門與內地特別是粵澳合作不斷深入。2009年，國務院先後批准《珠江三角洲地區改革發展規劃綱要（2008—2020）》《橫琴總體發展規劃》。2011年，粵澳雙方簽署《粵澳合作框架協議》，國務院批復同意珠海橫琴實行比經濟特區更加特殊的優惠政策。目前，澳門大學橫琴新校區建成啟用，港珠澳大橋等大型跨境基建加緊建設，中醫藥科技産業園等重點合作項目穩步推進；同時，經貿、旅遊等領域的合作勢頭良好。